故事以安倍昌浩的成長為主軸，出身的安倍家族，代代皆以陰陽師為業。但他一開始看不到妖魔鬼怪，努力尋找未來出路的昌浩，然後在某一天，他遇到了一隻小怪，然後京城被妖怪攻擊，這為了救這個小怪，他身上的封印解開了，他才想起原來他的陰陽師能力，其實是被他的爺爺給封住了，這跟《火影忍者》漩渦鳴人的設定也很像。
這個小怪，原來是爺爺的式神，十二神將之一的火將騰蛇-紅蓮，紅蓮其實可以變化成人型，但是平常都喜歡以妖怪的姿態跟昌浩互動。
後來，昌浩就跟十二神將：騰蛇(紅蓮)、六合、太陰、青龍、白虎、朱雀、玄武、天一、勾陣、天后、天空，一起四處除魔，解決居住於平安京的小妖、異邦的大陸妖怪等等，另外，降妖除魔的過程、陰陽師使用的咒術，也很精彩。
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